Тема: «Изучение закономерностей роста и развития микроорганизмов в водах разного генезиса, в засоленных почвах и в среде обитания человека»
Цель НИР по теме: «Изучение генетического и фенотипического разнообразия микроорганизмов в среде обитания человека, в реках Предуралья и в растительно-бактериальных сообществах»
Основные научные задачи на 2013-2020 гг.:
Структурно-функциональная организация микробных сообществ в экстремальных условиях в природных и техногенных экосистемах Предуралья, Приполярного Урала и ряда регионов Арктики и Антарктики;
Комплексные исследования альго-бактериальных сообществ рек Предуралья;
Изучение взаимодействия злаковых растений и симбиотических микроорганизмов - продуцентов биологически активных соединений;
Экологическая генетика антибиотикоустойчивых полирезистентных штаммов бактерий различных родов. Изучение роли бактерий рода Acinetobacter (первоначально известных как водные и почвенные сапрофиты) в микробной экологии человека;
Генезис и эволюция адаптивных систем бактерий и архей.
В 2019-2020 гг. к.б.н. Д.Ю.Шаравин являлся ведущим микробиологом 65-й Российской Антарктической экспедиции, совершил кругосветное плавание, отбирал пробы воды, льда и биоматериал в океане и в районе нескольких исследовательских станций
