Региональная профилированная коллекция алканотрофных микроорганизмов (ИЭГМ)

УНУ создана в 1988 году

Данная УНУ была поддержана в рамках мероприятия 1.8 ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»

Адрес: 614081, г. Пермь, ул. Голева, д. 13
http://www.iegmcol.ru
 
Руководитель работ:
Ившина Ирина Борисовна
(342) 280-81-14
ivshina@iegm.ru

Приказ об организации УНУ (Подписано директором ИЭГМ УрО РАН, чл.корр. РАН В.А. Демаковым, 14 мая 2011 г.)

Положение о коллекции ИЭГМ (Утверждено директором ИЭГМ УрО РАН, чл.корр. РАН В.А. Демаковым, 14 января 2013 г.)

Каталог коллекции ИЭГМ

Порядок доступа к штаммам микроорганизмов коллекции ИЭГМ

Порядок расчета стоимости выполнения работ

Проект Договора-соглашения на выдачу штаммов

Проект Договора на выполнение НИР

Письмо-запрос на депонирование штаммов в коллекцию

Проект Договора на депонирование штаммов в коллекцию

Перечень оборудования в составе УНУ

Технологический паспорт коллекции

Заключительный отчет о выполнении НИР “Инвентаризация и развитие региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов общебиологического и биотехнологического назначения” (Доп. Соглашение № 007-03-028/4 от 09.11.2017) (pdf)

Информация об уникальной научной установке (УНУ)
Реально действующая в Уральском регионе Региональная профилированная коллекция алканотрофных микроорганизмов (официальный акроним ИЭГМ, www.iegmcol.ru) предназначена для сбора, детального изучения и гарантированного сохранения аутентичных непатогенных штаммов микроорганизмов, ведущих окисление природных и антропогенных углеводородов. При разработке концепции профиля Коллекции ИЭГМ учитывался тот факт, что Пермский край – один из перспективных нефтегазопромысловых районов Российской Федерации, что сопряжено с экологическими проблемами, в том числе нефтяными загрязнениями. Аналоги такой коллекции отсутствуют. Собранный генофонд микробных культур с высокой активностью оксигеназного ферментного комплекса  − удобный объект для изыскания новых продуцентов ценных веществ, деструкторов и трансформаторов ксенобиотиков и активных биоаккумуляторов ионов тяжелых металлов, а также для конструирования новых форм и создания новых биологических технологий. Биоресурсы коллекции ИЭГМ реально использовать в различных областях биотехнологии и защиты окружающей среды − от биоиндикации углеводородных залежей до интенсификации процессов биодеградации нефтяных углеводородов и биокатализа в тонком органическом синтезе. Коллекция ИЭГМ располагает автоматизированной базой данных,  современными методами характеристики и идентификации культур, а также квалифицированным персоналом, имеющим навыки работы с углеводородокисляющими микроорганизмами, таксономический опыт и практику профессионального хранения биотехнологически ценных живых культур. Опыт и профессионализм специалистов позволяет проводить на базе коллекции ИЭГМ сервисные работы по таксономическому анализу штаммов и обучающие курсы с предоставлением рабочего места исследователям для овладения методами детекции, культивирования и идентификации алканотрофов, а также предоставлять консультации по вопросам выделения, таксономии, биологических особенностей и консервации поддерживаемых культур. Деятельность специализированной коллекции помимо фундаментальных исследований (комплексное изучение биологии алканотрофов, адаптационных механизмов их выживания в антропогенно нарушенных экосистемах) и собственно коллекционной работы (адекватный сбор природного материала, классификация и таксономическое описание изолятов, оценка их биотехнологической пригодности, разработка методов долгосрочного хранения культур и их функционального разнообразия, совершенствование информационного сопровождения культур в соответствии с международными стандартами, обеспечение непрерывности в передаче потребителям штаммов и накопленной научной информации о них) включает прикладные исследования (получение новых препаратов, разработка перспективных технологий) с использованием коллекционного генофонда алканотрофов. Номенклатурная ревизия поддерживаемых культур с использованием современных методов полифазной таксономии проводится с периодичностью один раз в два года. Биологическая информация о штаммах представлена в систематически издаваемых каталогах. Среди пользователей − различные коллективы отечественных и зарубежных вузов и исследовательских учреждений, специалисты в области микробиологии, биотехнологии, экологии и медицины, инженерно-технические работники промышленных предприятий, преподаватели и студенты вузов. Для учебных целей культуры предоставляются безвозмездно. Биоресурсы коллекции ИЭГМ активно востребуются в рамках федеральных и международных программ, на базе УНУ выполняются междисциплинарные проекты с привлечением математиков, химиков, физиков, фармацевтов.

Главные преимущества, обоснование уникальности установки, в том числе сопоставление УНУ с существующими аналогами
Региональная профилированная коллекция алканотрофных микроорганизмов (официальный акроним ИЭГМ, www.iegmcol.ru) − единственная и сравнительно молодая российская коллекция, специализирующаяся на сборе, изучении и поддержании аутентичных непатогенных практически ценных микробных культур, деструктирующих нефтяные углеводороды и ксенобиотики. Коллекция ИЭГМ является членом Всемирной Федерации коллекций культур, Европейской организации коллекций культур, включена во Всемирный справочник коллекций культур, входит в сеть специализированных российских микробиологических коллекций немедицинского профиля, располагает каталожной базой данных, интегрированной в международную поисковую систему по штаммам микроорганизмов Биологических ресурсных центров, современными методами полифазной таксономии, а также квалифицированным персоналом, имеющим навыки работы с углеводородокисляющими микроорганизмами, таксономический опыт и практику профессионального хранения живых культур. Генофонд коллекции включает 3422 чистых идентифицированных детально охарактеризованных штаммов, выделенных из образцов почв, ризосферы, поверхностных и пластовых вод, снега, воздуха, керна, отобранных из контрастных эколого-географических регионов. Принцип отбора штаммов в коллекцию по таксономическим и функциональным критериям − их потенциальная перспективность для работ по биотехнологии и защите окружающей среды. Среди коллекционных культур широко представлены экстремотолерантные штаммы с высокой активностью оксигеназ, имеющие значительный потенциал для промышленной эксплуатации; штаммы-биопродуценты аминокислот, ферментов, липидов с высоким содержанием ненасыщенных жирных кислот, биосурфактантов; штаммы-биодеструкторы экополлютантов, в том числе сырой нефти и нефтепродуктов. Коллекция ИЭГМ располагает типовыми и референтными штаммами, принадлежащими к 30 родам и 96 видам бактерий. В коллекции собран наиболее полный в стране и за рубежом фонд непатогенных штаммов актинобактерий рода Rhodococcus с высокой активностью оксигеназного комплекса. С учетом изученных структурных и физиологических особенностей коллекционных штаммов разработаны оптимальные режимы криоконсервации и лиофилизации культур с предварительно индуцированным алканотрофным обменом. Коллекция ИЭГМ по своему объему, представленному видовому разнообразию, спектру научного и прикладного применения коллекционных штаммов, выполняемым функциям сопоставима с фондами ведущих европейских центров микробных биоресурсов и входит в число российских коллекций, по степени готовности отвечающим требованиям формирования Биологического ресурсного центра.

Основные направления научных исследований, проводимых с использованием УНУ
* Структура и функция микробных сообществ. Оценка роли микроорганизмов в биосферных процессах;
* Молекулярно-генетические механизмы адаптации микроорганизмов к стрессорным факторам. Регуляция роста и развития микроорганизмов в экспериментальных условиях и природных экосистемах;
* Анализ генов метаболизма органических соединений. Природные микроорганизмы, селекция высокопродуктивных штаммов и создание эффективных биокатализаторов, перспективных для получения новых фармакологических средств и биоремедиации загрязненных экосистем.

Услуги
* Предоставление коллекционных штаммов актинобактерий для исследовательских целей
* Молекулярно-генетический анализ штаммов актинобактерий
* Предоставление коллекционных культур Rhodococcus spp. для практикума по микробиологии
* Определение биодоступности фармполлютантов для актинобактерий
* Определение биодоступности полициклических терпеноидов и органических сульфидов для актинобактерий
* Таксономический анализ штаммов актинобактерий
* Направленный поиск ризосферных актинобактерий с высокой активностью оксигеназного комплекса
* Депонирование штаммов алканотрофных актинобактерий на хранение
* Обучающие курсы по методам выделения, культивирования и идентификации алканотрофных актинобактерий
* Обучающие курсы по идентификации углеводородокисляющих микроорганизмов, выделенных из природных источников
* Сопровождение научно-исследовательских работ аспирантов и магистров
* Сопровождение научно-исследовательских работ магистров и студентов
* Проведение практических занятий по систематике прокариот для магистров
* Проведение практических занятий по нефтяной микробиологии для магистров
* Проведение занятий Большого практикума по микробиологии для студентов

Фото